회사를 다니다가 연도 중간에 퇴사하면 연말정산은 어떻게 해야 할까요?
보통 직장인은 다음 해 1~2월 회사에서 연말정산을 하지만, 중도퇴사자는 상황이 조금 다릅니다.
퇴사할 때 회사에서 한 번 세금을 정산하고, 이후 같은 해에 다른 회사로 이직했는지 또는 연말까지 취업하지 않았는지에 따라 처리 방법이 달라집니다.
특히 퇴사 당시에는 의료비, 신용카드 사용액, 월세, 기부금 등 각종 공제가 충분히 반영되지 않을 수 있어 다음 해 5월 종합소득세 신고를 통해 추가 환급을 받을 수 있는 경우도 있습니다.
이번 글에서는 중도퇴사자의 연말정산 방법부터 재취업한 경우, 미취업한 경우, 종합소득세 신고와 환급 방법까지 정리해 보겠습니다.
1. 퇴사하면 회사에서 연말정산을 해줄까?
연도 중간에 퇴사하면 회사는 일반적으로 마지막 급여를 지급할 때 중도퇴사자에 대한 근로소득 세액을 정산합니다.
예를 들어 2026년 8월까지 근무하고 퇴사했다면 회사는 1월부터 8월까지 지급한 급여와 원천징수한 세금을 기준으로 정산하게 됩니다.
문제는 일반적인 연말정산처럼 모든 소득·세액공제가 충분히 반영되지 않을 수 있다는 것입니다.
퇴사 시점에는 연말정산 간소화 자료가 완성되어 있지 않고 근로자가 각종 증빙자료를 회사에 제출하지 않은 경우도 많기 때문입니다.
따라서 퇴사할 때 회사에서 세금 정산을 했다고 해서 반드시 모든 연말정산 절차가 끝났다고 생각하면 안 됩니다.
2. 중도퇴사자 연말정산은 재취업 여부가 중요하다
퇴사 후 가장 먼저 확인할 것은 같은 해에 다른 회사에 취업했는지입니다.
상황연말정산 방법
| 같은 해 다른 회사 재취업 | 새 회사에서 전 직장 소득까지 합산해 연말정산 |
| 연말까지 미취업 | 다음 해 5월 종합소득세 신고 검토 |
| 재취업했지만 전 직장 소득 미합산 | 다음 해 5월 종합소득세 신고로 합산 |
| 퇴사 시 빠진 공제가 있음 | 종합소득세 신고 등을 통해 추가 반영 가능 |
따라서 재취업 여부에 따라 처리 방법이 완전히 달라진다고 생각하면 이해하기 쉽습니다.
3. 같은 해에 다른 회사로 이직했다면?
예를 들어 2026년 6월에 A회사를 퇴사하고 2026년 8월 B회사에 입사했다고 가정해 보겠습니다.
이 경우 다음 해 초 B회사에서 연말정산을 할 때 A회사에서 받은 근로소득도 함께 합산해서 정산해야 합니다.
이를 위해 전 직장에서 발급받은 근로소득 원천징수영수증을 새로운 회사에 제출하는 것이 중요합니다.
예를 들면 다음과 같습니다.
- A회사 근로소득 : 2,500만 원
- B회사 근로소득 : 2,000만 원
이 경우 B회사 소득 2,000만 원만 가지고 연말정산하는 것이 아니라 A회사와 B회사의 근로소득을 합산하여 정산하는 방식입니다.
따라서 이직했다면 전 직장의 근로소득 원천징수영수증을 챙겨두는 것이 좋습니다.
4. 전 직장 원천징수영수증은 왜 필요할까?
근로소득 원천징수영수증에는 전 직장에서 받은 급여와 이미 납부한 세금 등이 기록되어 있습니다.
새로운 회사에서는 이 자료를 이용해 이전 직장의 소득까지 합산하여 연말정산을 할 수 있습니다.
따라서 퇴사할 때 가능하다면 다음 자료를 챙겨두는 것이 좋습니다.
① 근로소득 원천징수영수증
② 마지막 급여명세서
③ 퇴직금 관련 서류
④ 필요한 경우 각종 소득·세액공제 증빙자료
원천징수영수증을 바로 받지 못했다면 회사에 발급을 요청하거나 지급명세서가 국세청에 제출된 이후 홈택스에서 확인할 수 있는지 살펴볼 수 있습니다.
5. 퇴사 후 연말까지 취업하지 않았다면?
중도퇴사자가 가장 헷갈리는 경우입니다.
예를 들어 2026년 7월 회사를 퇴사한 뒤 2026년 12월 31일까지 새로운 직장에 취업하지 않았다고 가정해 보겠습니다.
퇴사 당시 전 직장에서 중도정산은 이루어졌지만 충분히 반영하지 못한 소득·세액공제가 있을 수 있습니다.
이런 경우에는 2027년 5월 종합소득세 신고기간에 본인이 직접 신고하면서 누락된 공제를 반영할 수 있습니다.
국세청에서도 연말정산 때 놓친 공제와 감면은 종합소득세 신고를 통해 추가 반영할 수 있다고 안내하고 있습니다.
6. 퇴사할 때 환급받았는데 또 환급받을 수 있을까?
가능한 경우가 있습니다.
퇴사할 때 받은 환급금은 퇴사 시점까지 회사에서 계산한 중도정산 결과입니다.
하지만 이후 종합소득세 신고에서 기존에 반영되지 않았던 공제를 추가하면 최종 결정세액이 다시 계산됩니다.
예를 들어 퇴사 당시에는 다음 항목들이 제대로 반영되지 않았다고 가정해 보겠습니다.
- 의료비
- 교육비
- 기부금
- 월세 세액공제
- 연금계좌 세액공제
- 일부 보험료
- 기타 누락된 소득·세액공제
종합소득세 신고 과정에서 공제요건을 충족하는 항목을 추가하면 이미 납부한 세금이 최종 결정세액보다 많아져 추가 환급이 발생할 수 있습니다.
다만 종합소득세 신고를 한다고 무조건 환급되는 것은 아닙니다.
개인의 총소득과 이미 납부한 세금, 공제금액 등을 다시 계산한 결과에 따라 환급될 수도 있고 추가 납부가 발생할 수도 있습니다.
7. 중도퇴사자는 왜 공제가 빠질까?
일반 직장인의 연말정산은 한 해가 끝난 뒤 연말정산 간소화 자료를 확인하면서 진행됩니다.
하지만 중도퇴사자는 연도 중간에 정산하기 때문에 연간 자료가 모두 확정되지 않은 상태일 수 있습니다.
또한 근로자가 별도로 증빙해야 하는 공제자료를 퇴사 당시 회사에 제출하지 않는 경우도 있습니다.
그래서 퇴사 당시 정산 결과만 보고 끝내기보다는 다음 해에 본인이 받을 수 있는 공제가 빠지지 않았는지 다시 확인하는 것이 좋습니다.
8. 퇴사 후 사용한 신용카드도 공제될까?
여기서 주의할 부분이 있습니다.
연말정산 공제항목 중에는 근로자로 재직한 기간에 지출한 금액만 공제되는 항목이 있습니다.
대표적으로 신용카드 등 사용금액에 대한 소득공제는 근로를 제공한 기간에 사용한 금액을 기준으로 확인해야 합니다.
예를 들어 2026년 1월부터 6월까지 근무하고 7월부터 연말까지 미취업 상태였다면 공제 대상 금액을 계산할 때 근무기간 여부를 확인해야 합니다.
반면 항목에 따라 연간 지출액을 기준으로 적용할 수 있는 공제도 있습니다.
따라서 중도퇴사자의 종합소득세 신고에서는 각 공제항목의 근로기간 적용 여부를 구분하는 것이 중요합니다.
9. 의료비도 퇴사 후 사용한 금액까지 공제될까?
의료비 세액공제 역시 중도퇴사자가 특히 주의해야 하는 항목입니다.
중도퇴사자의 경우 의료비·교육비·신용카드 등 일부 공제는 근로를 제공한 기간과 관련된 제한을 확인해야 합니다.
예를 들어 1월부터 8월까지 근무했다면 9~12월 미취업 기간에 지출한 금액이 모두 동일하게 공제되는 것으로 생각해서 신고하면 안 됩니다.
홈택스 간소화 자료에 금액이 표시된다고 해서 그 금액 전체가 자동으로 공제 대상이라는 의미는 아닐 수 있으므로 실제 공제 가능 금액을 구분해야 합니다.
10. 퇴사 후 국민연금·건강보험료는 어떻게 될까?
국민연금과 건강보험료 역시 연말정산 과정에서 확인해야 할 항목입니다.
재직 중 급여에서 공제된 국민연금과 건강보험료 등은 회사의 중도정산 과정에서 반영될 수 있습니다.
퇴사 후에는 건강보험 자격이 지역가입자로 변경되거나 가족의 피부양자가 되는 등 자격 자체가 달라질 수 있습니다.
따라서 퇴직 전 급여에서 납부한 보험료와 퇴직 후 개인적으로 납부한 보험료는 구분해서 확인하는 것이 좋습니다.
11. 5월 종합소득세 신고는 어떻게 할까?
연말까지 재취업하지 않았거나 연말정산에서 공제를 빠뜨렸다면 다음 해 5월 종합소득세 신고를 확인합니다.
국세청 홈택스에서는 다음과 같은 경로로 신고할 수 있습니다.
홈택스 로그인
↓
세금신고
↓
종합소득세 신고
↓
근로소득 신고
↓
정기 신고
↓
근로소득 및 공제내역 확인
↓
누락된 소득·세액공제 입력
↓
환급 또는 추가납부 세액 확인
↓
신고서 제출
국세청은 종합소득세 신고기간에 연말정산에서 누락한 공제·감면을 추가로 반영할 수 있도록 안내하고 있습니다.
12. 종합소득세 신고하면 환급금은 언제 받을까?
종합소득세 신고 결과 환급이 발생하면 신고서에 환급받을 본인 명의 계좌를 입력할 수 있습니다.
국세청의 2026년 안내에 따르면 정기 신고기간에 추가 공제를 반영해 발생한 종합소득세 환급금은 신고기한으로부터 30일 이내 신고서에 기재한 본인 명의 계좌로 지급됩니다.
지방소득세 환급은 종합소득세 환급 이후 별도로 지방자치단체에서 처리될 수 있습니다.
따라서 신고 후에는 홈택스에서 환급 진행상황과 입력한 계좌를 확인해 두는 것이 좋습니다.
13. 예를 들어 알아보기
직장인 A씨가 2026년 1월부터 8월까지 근무한 뒤 퇴사했다고 가정해 보겠습니다.
총급여는 3,000만 원이고 회사에서 매월 소득세를 원천징수했습니다.
8월 퇴사 당시 회사에서 중도정산을 했지만 월세 세액공제 등 일부 공제가 반영되지 않았습니다.
A씨는 2026년 말까지 재취업하지 않았습니다.
이 경우 다음 해인 2027년 5월 종합소득세 신고기간에 근로소득 신고를 하면서 요건을 충족하는 누락 공제를 추가로 반영할 수 있습니다.
다시 계산한 최종 세금보다 이미 납부한 세금이 많다면 차액을 환급받게 됩니다.
14. 재취업했는데 전 직장 소득을 합산하지 않았다면?
이것도 주의해야 합니다.
예를 들어 A회사에서 3,000만 원, B회사에서 2,000만 원을 받았는데 B회사에서 연말정산할 때 A회사의 근로소득을 합산하지 않았다고 가정해 보겠습니다.
각 회사의 소득을 따로 계산한 결과만으로 세금 정산이 끝났다고 생각해서는 안 됩니다.
다음 해 종합소득세 신고에서 근로소득을 합산하여 최종 세액을 계산해야 할 수 있습니다.
이 경우에는 환급이 아니라 추가 납부세액이 발생할 가능성도 있으므로 반드시 확인하는 것이 좋습니다.
15. 퇴직금도 종합소득세에 합쳐질까?
일반적인 퇴직금은 근로소득과 다른 퇴직소득으로 구분됩니다.
따라서 일반적인 퇴직소득을 단순히 근로소득에 더해서 연말정산하는 것은 아닙니다.
퇴직금에는 별도의 퇴직소득 과세체계가 적용됩니다.
즉, 퇴직 당시 받은 급여와 퇴직금을 같은 소득이라고 생각해서 합산하면 안 됩니다.
16. 실업급여를 받았다면 연말정산에 포함될까?
퇴직 후 실업급여를 받는 경우도 많습니다.
고용보험에 따라 받는 실업급여는 비과세 소득이므로 일반적으로 근로소득 연말정산을 할 때 과세 근로소득에 합산하지 않습니다.
따라서 실업급여를 받았다는 이유만으로 해당 금액을 근로소득에 더해서 신고하는 것은 아닙니다.
17. 중도퇴사자가 꼭 챙겨야 할 서류
퇴사할 때 가장 중요한 서류 중 하나가 근로소득 원천징수영수증입니다.
추가로 다음 자료를 확인해 두면 좋습니다.
서류·자료용도
| 근로소득 원천징수영수증 | 전 직장 급여·납부세액 확인 |
| 연말정산 간소화 자료 | 각종 공제 확인 |
| 월세 관련 서류 | 월세 세액공제 검토 |
| 기부금 영수증 | 기부금 세액공제 |
| 의료비·교육비 자료 | 해당 세액공제 검토 |
| 연금계좌 납입자료 | 연금계좌 세액공제 확인 |
| 기타 공제 증빙 | 간소화에서 조회되지 않는 자료 확인 |
특히 전 직장 원천징수영수증의 결정세액과 기납부세액, 차감징수세액 등을 확인하면 퇴사 당시 세금이 어떻게 정산됐는지 파악하는 데 도움이 됩니다.
18. 중도퇴사자 연말정산 순서 한눈에 보기
퇴사
↓
회사에서 퇴사 시점까지 중도정산
↓
같은 해 재취업했다면
전 직장 근로소득 원천징수영수증 준비
↓
새 회사에 제출
↓
새 회사에서 전·현 직장 소득을 합산하여 연말정산
연말까지 재취업하지 않았다면
전 직장 원천징수영수증 확인
↓
다음 해 연말정산 간소화 자료 확인
↓
5월 종합소득세 신고
↓
누락된 공제 반영
↓
환급 또는 추가 납부세액 확인
FAQ
Q1. 6월에 퇴사하면 연말정산을 안 해도 되나요?
퇴사 시 회사에서 퇴직 시점까지의 근로소득을 기준으로 중도정산을 합니다. 이후 같은 해 재취업 여부와 누락된 공제 여부에 따라 새 회사의 연말정산 또는 다음 해 5월 종합소득세 신고가 필요할 수 있습니다.
Q2. 퇴사하면서 세금을 환급받았는데 5월에 또 받을 수 있나요?
가능합니다. 퇴사 당시 반영하지 못했던 공제항목을 종합소득세 신고에서 추가로 반영해 최종 결정세액이 줄어들면 추가 환급이 발생할 수 있습니다.
Q3. 퇴사 후 바로 다른 회사에 취업하면 어떻게 하나요?
전 직장에서 받은 근로소득 원천징수영수증을 새 회사에 제출해 전·현 직장의 근로소득을 합산하여 연말정산하는 것이 일반적인 방법입니다.
Q4. 퇴사 후 연말까지 취업하지 않으면 어떻게 하나요?
퇴사 당시 회사에서 중도정산을 한 뒤, 누락된 공제가 있다면 다음 해 5월 종합소득세 신고를 통해 반영할 수 있습니다.
Q5. 실업급여도 연말정산 소득에 포함되나요?
고용보험에 따라 지급되는 실업급여는 비과세이므로 일반적인 근로소득 연말정산의 과세 근로소득에 포함하지 않습니다.
Q6. 퇴직금도 5월 종합소득세에 합산하나요?
일반적인 퇴직금은 퇴직소득으로 별도 과세되기 때문에 일반 근로소득과 단순 합산하여 연말정산하는 방식은 아닙니다.
Q7. 5월 신고를 놓쳤다면 환급을 못 받나요?
정기 신고기간을 놓쳤다고 해서 모든 방법이 사라지는 것은 아닙니다. 신고 여부와 기존 신고내용에 따라 기한후신고나 경정청구 등을 검토할 수 있으므로 홈택스 또는 세무서를 통해 확인하는 것이 좋습니다.
한눈에 요약
상황처리방법
| 연도 중 퇴사 | 회사에서 중도정산 |
| 같은 해 재취업 | 새 회사에서 전 직장 소득 합산 연말정산 |
| 연말까지 미취업 | 다음 해 5월 종합소득세 신고 검토 |
| 퇴사 당시 공제 누락 | 종합소득세 신고 등을 통해 추가 반영 |
| 세금을 많이 냈음 | 환급 가능 |
| 세금을 적게 냈음 | 추가 납부 가능 |
| 실업급여 | 비과세 |
| 일반적인 퇴직금 | 퇴직소득으로 별도 과세 |
중도퇴사자의 연말정산에서 가장 중요한 것은 퇴사했다고 연말정산이 완전히 끝난 것은 아니라는 점입니다.
같은 해에 재취업했다면 전 직장 원천징수영수증을 새로운 회사에 제출해 소득을 합산하고, 연말까지 재취업하지 않았다면 다음 해 5월 종합소득세 신고 때 누락된 공제가 없는지 확인하는 것이 좋습니다.
특히 의료비, 월세, 기부금, 연금계좌 등 퇴사 당시 반영하지 못한 항목이 있다면 추가 환급 가능성이 있으므로 원천징수영수증과 연말정산 간소화 자료를 함께 확인해 보는 것이 중요합니다.
※ 참조사항
중도퇴사자의 실제 환급금은 총급여, 퇴사 시기, 이미 납부한 세금, 재취업 여부 및 소득·세액공제 항목에 따라 달라집니다. 또한 공제항목에 따라 근로기간 중 지출한 금액만 인정되는 경우가 있으므로 홈택스 신고 시 공제요건을 확인해야 합니다. 세법과 신고기간은 귀속연도에 따라 달라질 수 있으므로 실제 신고 시 국세청의 해당 연도 안내를 확인하시기 바랍니다.
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